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Nachwuchsgruppe MoMoTuBo

MoMoTuBo Logo Florian Auer

F?rderung

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F?rderkennzeichen:

01ZZ2008
F?rdersumme:? ? ? ?? 1.370.633 EUR
F?rderzeitraum:? 2021 - 2025
Projektleitung: Dr. Zaynab Hammoud
F?rdermittelgeber: Bundesministerium für Forschung und Bildung (BMBF)

Abstrakt

Im Molekularen Tumorboard werden basierend auf einer Reihe verschiedener Datentypen (klinische Daten, radiologische Daten, histopathologische Daten, genomische Daten, Genexpressionsdaten, ggf. weitere Hochdurchsatzdaten) Therapieentscheidungen für Krebspatienten getroffen. Dazu werden mittels bioinformatischer Methoden bestimmte Features (z. B. bestimmte Mutationen oder Genexpressionsmuster) priorisiert. Basierend darauf werden dann durch (h?ufig manuell ausgeführte) Datenbankrecherchen Therapievorschl?ge erarbeitet und interdisziplin?r diskutiert. Unklar ist jedoch wie fortschreitendes Wissen und Daten aus externen Quellen in einem standard-getriebenen Prozess in die Arbeit der molekularen Tumorkonferenz integriert werden kann. Auch gibt es keine systematische Erfassung früherer Patienten und Empfehlungen, die es erm?glichen würden, aktuelle Patienten mit ?hnlichen früheren Patienten zu vergleichen. Um auf gro?e Fallzahlen zurückgreifen zu k?nnen, sollte eine Vernetzung mit den Molekularen Tumorboards anderer Standorte erreicht werden. Ziele: Erstens, die Konzeptionierung einer modular aufgebauten Plattform für das MTB, bei dem Reproduzierbarkeit, Dokumentation und Update-Mechanismen entlang des Prozesses verwirklicht werden. Zweitens, die Erstellung eines Konzepts zur Anbindung der klinischen Routine und der Forschungsdaten. Drittes Ziel ist die verst?rkte Automatisierung der Datenintegration und die Aufarbeitung unter Einbeziehung externen Wissens. Das vierte gro?e Ziel ist die Entwicklung von Machine Learning Verfahren für die Analyse im Rahmen des MTB. Hierunter f?llt bspw. die Nutzung von unstrukturiertem Wissen (z. B. Arztbriefe), die Generierung komplexer Signaturen zur Modellierung von Therapieansprechen sowie die Identifikation ?hnlicher Patienten. Schlie?lich ist das fünfte Ziel die Implementierung eines Prototyps und quelloffene Software für eine modulare reproduzierbare Software-Plattform für das MTB.

Allgemeine Kontaktinformationen

Anschrift:

Lehrstuhl für Translationale Medizinische Forschung

Fakult?t für Angewandte Informatik

Universit?t Augsburg
Alter Postweg 101

86159 Augsburg

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Anfahrt

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Sekretariat:
Telefon: +49 821 598 -3738

Fax: +49 821 598 -3739

E-Mail: sekretariat-misit@informatik.uni-augsburg.de

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Geb?ude:
Büro Center Messe (BCM) - 9. Stock

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